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1、祛寒止痛。吴茱萸味辛、性温，可以用于因经脉受寒而引起的头痛、腹痛和*等多种症状。吴茱萸搭配人参、生姜煮成吴茱萸汤，服用有助于缓解因风寒而引发的头晕、头痛和呕吐。
2、补阳止泻。吴茱萸苦燥，能燥湿、补阳，可以用来治疗腹泻，吴茱萸配以补骨脂、肉豆蔻、五味子等用用，可以达到温脾益肾、助阳止泻的功效。
3、降压。科学实验证明，吴茱萸可以使外周血管扩张，减少外周血管的阻力，从而起到降血压的效果。
4、健胃。吴茱萸中所含的吴茱萸苦素是苦味质，具有苦味健胃的功能。此外，吴茱萸所含的挥发油，又具有芳香健胃作用。
5、镇痛。吴茱萸中的吴茱萸碱、吴茱萸次碱、异吴茱萸碱和吴茱萸内酯都是镇痛成分，可以增强中枢神经系统的作用。
6、驱蛔虫。吴茱萸醇提物在体外可以消灭猪蛔虫，对蚯蚓和水蛭也有致命作用。