一、若暴雨水浸属于可排除，未达到不可抗力层次的，承包方应当排除障碍，继续施工，若擅自停工的，应当按照合同约定承担违约责任，赔偿发包人的相关损失。
二、若暴雨水浸属于不可抗力的自然灾害，承包人停工也无可厚非，那么双方可按照以下方式处理赔偿事宜：
(1)工程本身的损害，因工程损害导致第三人人员*和财产损失，以及运送至施工现场用于施工的材料和待安装设备的损害，由业主承担。
(2)发包人，承包人的人员*由其所属单位负责，并承担相应费用。
(3)造成施工单位机械、设备的损坏及停工等损失，由施工单位(承包人)承担。
【法律依据】
《建筑法》第七十条规定，违反本法规定，涉及建筑主体或者承重结构变动的装修工程擅自施工的，责令改正，处以罚款；造成损失的，承担赔偿责任；构成犯罪的，依法追究刑事责任。