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福建福州自然保护区有两个：
雄江黄楮林自然保护区，*级(建区)：
地处福建省闽清县的西部，地理坐标北纬?～?、东经?～?，总面积m其中：核心区面积m缓冲区面积m
保护区主要保护对象：以福建青冈林为代表中*带南缘基带常绿阔叶林森林生态系统、溪流类湿地生态系统、珍稀濒危野生动植物及栖息地、闽江水源涵养林。
福建长乐闽江河口*湿地公园，*级(建区)：
位于福建省福州*乐区潭头、梅花镇闽江入海口处，有河口水域、潮间带沙滩、红树林沼泽等湿地类型，是候鸟迁徙重要越冬地、水鸟集中分布区、众多珍稀濒危鸟种的栖息地，多项指标达到国际重要湿地标准。
省、市林业部门专家、学者多年的研究调查结果显示，闽江口湿地自然环境优越、生物多样性丰富、稀有物种众多，拥有动植物，估计在此迁徙停歇的水鸟数量超过只。在“美丽中国·湿地行”活动中被评为“中国**美湿地”。