南京公积金网上查询流程是：
1、进入南京住房公积金*中心网上办事大厅，选择“个人密码用户”；
2、进入登录页面，证件号码为本人身份证号码，个人初始密码为公积金*后四位 00。
*流程为：
1、人脸识别登录：职工点击“人脸识别用户”，输入姓名和证件号码，点击“立即登录”，系统自动生成二维码，职工用支付宝扫描二维码并进行人脸识别操作，人脸识别通过即登录成功。
2、个人密码登录：职工点击“个人密码用户”，输入证件号码、密码和验证码即可登录。初始密码为个人住房公积金*后四位数字加两个“0”（建议登录后修改初始密码）。
3、点击“身份认证-网厅业务个人身份认证”菜单；
4、认证成功后即可办理网上提取申请。