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第一章分为两个阶段，上部为两个主线+两个支线，一般在任务简要说明之中;深红色的代表为主线而浅色的为支线，一般来说两者的完成过程不会互相影响。两个主线关于艾格妮玛II和确认帝国书记官两个都是比较简单的任务。第一个关于艾格妮玛II，先来到中央广场右边区域的道具店同温蒂对话，取得两个新的回路;给剩余的两个同伴装备上再同温蒂对话即可推进下一步任务。
之后会得到回路的详细解释说明，如果玩家没有了解清楚可以随时询问温蒂更加详细的内容，而温蒂一旁的柜员MM可以进行回路的购买和外壳的更换，温蒂可以进行回路的升级以及晶石的交换。
不同的回路作用不同，而新的回路往往可以在迷宫的宝箱，任务的奖励，以及部分的NPC处购买获得。
玩家可以先行进行伊梅尔达馆的通缉魔兽支线任务来，继续推进主线关于艾格妮玛II的战斗需求。
前往后巷的古董店，来到伊梅尔达婆婆处对话取得钥匙。打开旧城区的上层房间进入即可，迷宫不是很复杂一条路到头。
所有队友装备完毕回路战斗一次即可彻底完成主线关于艾格妮玛II。而该支线最终的BOSS则是一个形状大蚊子的超级巨型怪物，这个怪物没有太大难度，其攻击属性为毒属性。玩家只需集中力量消灭BOSS不必理会杂兵即可。
接下来则是我们第一章上部的第二个主线，确认帝国书记官。大名鼎鼎的书记官雷克特潜入到市内之中，由于达德里搜查官处于外地公务，所以该任务落到我们队伍的身上，来到行政区左边的警察总部。进入到一层最左边的房间同里面的MM对话，开启该主线的追踪剧情。
大家先来到后巷中部可以发现剧情，遇到记者格蕾丝和黑月商会的曹，根据格蕾丝的消息得知雷克特处于东街的龙老饭店。
来到龙老饭店，发现雷克特居然在和厨师学习麻辣豆腐的做法;之后雷克特发现大家追踪而来，大感不妙用言语让大厨缠住了众人而自己快速逃离。同大厨解释清楚之后，得到了厨师手册并且开启制作食物的游戏部分。玩家可以根据各个场景搜集的食谱来进行食物的制作。同时玩家此时可以拿取之前伊梅尔达馆深处不能拿取的食谱书了。
从龙老饭店出现，大家同路人对话一路追踪雷克特来到了中央广场的左部百货店上层。没想到询问几句之后，雷克特居然又迅速逃离，不得已之下，大家来到后巷再次询问路人得知其前往了欢乐街的左部赌场。
来到赌场，雷克特很出人意料之外的完全回答众人的所有提问。而突然出现的红发少女则将雷克特喊走，并且胸袭了艾利。
这里将游戏的任务系统做一下说明：每个阶段的碧之轨迹主线和碧之轨迹支线可以看作一个任务群，每个任务群之间都是相互独立的，而所谓的期限消失也是依据任务群划分的。建议各位玩家按照游戏之时将所有相关的主线和支线任务群完成，从而避免任务消失无法进行的状况。而碧之轨迹隐藏任务一般在本章节任务群所有主线进行完成之后，自动开启可进行，所以如果玩家进行隐藏任务的话，最好在所有的主线任务完成之后再进行启动完成。
这个任务很简单，就是简单的问答游戏。来到住宅街自动发生剧情，一行人差点被狂妄的飙车族撞到;之后同附近的警察联系来到欢乐街酒店附近的警察，与之对话开启该隐藏任务。
半途会遇到红发大叔，其自身散发的强大气场使得众人不得不感到惊异。而众人之后在道路边发现之前支线任务的西克洛斯贝尔街道的任务魔兽居然被全部杀死(同时该支线自动取消)，于是之后通过移动电话向总部调查人员汇报详细的信息。
其红发大叔的问题为简单的52。
从西克洛斯贝尔街道往南可以来到诺克斯森林道，这里没有什么太复杂的地方。注意森林道入口附近的北部拐弯小平台，会有100级的魔兽宝箱。不建议此时玩家打开，玩家基本不是这些怪物的对手。
一般而言，怪物宝箱和普通宝箱的花纹是不同的，玩家只需多打开几个即可分辨出来。沿途玩家可以通过宝箱捡取到回路，魔防1。
下面，解锁新的物件，导力车。玩家可以通过该工具在大地图的各个城镇进行快速的旅行。
冗长的剧情兑换后，众人对于导力车的便捷颇为兴奋，而大家也顺途前往北部的大教堂将刚下课的琪雅接送回家。琪雅对于新的导引车赞赏不已，之后大家回到总部继续开始下一阶段的征途。
有了导力车，玩家可以在大地图快速的在各个开放的安全城镇据点旅行。玩家可以通过游戏中搜集的一些特殊物品进行导力车的改装和升级。
回到总部仍然是冗长的剧情，同终端对话得知缇雅由于公务缠身而暂时无法回归。而之前返回的路途可以得知兰迪正在同着队友进行新兵的训练缠身，大家只得继续进行下一阶段的委托。
链接终端可以开始我们第一章的下半部分的任务。下半部分为三个主线。这三个主线进行的先后顺序没有区别，都不会互相影响;故我这里按照其初始的顺序进行。