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《极限脱出3：零时困境》为备受玩家好评的“极限脱出”的最新作，将会延续该系列一贯的探索和压抑风格。据官方消息，《极限脱出3：零时困境》的背景设定在《极限脱出999：9小时9人9扇门》的事件发生一年后。新作中会看到前作中人物的回归和后续。《极限脱出3：零时困境》中将会有10名角色登场，事件场景部分将会是实机3D建模来表现。游戏的故事发生在2028年12月，也就是在《极限脱出：9小时9人9门》一年以后。在《极限脱出：善人死亡》发生的时间中间，发生了《极限脱出：零时困境3》的事件。
剧情：（2028年12月31日）Dcom在Devada沙漠的防空洞内，9名被困少年苏醒过来，他们手上都被带上了手铐，他们分别三人为一组被囚禁在三个禁闭室内。而且囚室的铁门只能够从外面打开。
其中一名带着头套的小孩似乎在场其他人都不认识。
此时一个自称是零二世的人出现，他表示在在座9个人参加一场游戏，他会掷出一个硬币（他称之为关系到全人类的游戏），然后让小队领袖卡洛斯代表其余九个人猜藏在零二世脚下的硬币是哪个面?答对就能够拯救这里的所有人，答错就需要参加杀人游戏。
第二次正确答案是红色，要进行游戏，就得选择错误的答案。
剧情：（CQD：END1）零二世表示会释放所有人，但需要所有人都睡去，在频临晕厥时，卡洛斯似乎意识到零二世是何许人也。
当众人醒来后，他们发现已经置身于防空洞的户外，可是他们的记忆都被消除，只有隐约记得一些东西。
剧情：众人并没有过多责怪卡洛斯选了错误的硬币面，他们都把矛头对准开始这一切的那个人。
剧情：当大伙都醒来后，零二世讲述了一个故事。
十七年前，一个女人去公园跑步，当天她选择了一条不同的路线却碰见时常在既定路线见到的熟人，熟人问她变更路线的理由，居然是因为一只蜗牛。结果几小时后，这个女人却被人谋杀了。
如今他们被划分在三个区域内，卡洛斯、茜、淳平为C组，分在C区，队长是卡洛斯;Q、米拉和埃里克为Q组，分在Q区，队长是Q;戴安娜、派和西格玛是D组，分在D区，队长是戴安娜。
在各自的区域内可以随意闲逛，但只有90分钟，超过时间，手环就会给人注射一种能抹除记忆的麻醉剂。
这座建筑物的出口就是X的电梯门厅，输入X密码就可以打开这道门，要解锁它，每死去一个人就可以获得一个X密码，总共需要6位数。
每个组可以投一票，超过限定时间不投票的小组自动被投两票，获得两票或以上的小组会遭到处决。
卡洛斯认为这是Dcom的心理测试，可是淳平则认为零二世是认真的。茜提出这次游戏选择分散投票，只要三个组互投，C组投给D组，D组投给Q组，Q组投给C组，那么就不会有小组遭到处决。
可是三人却发现墙上写着可怕的字样“let the game end where i treat two”，另外淳平还发现一个强制终止箱，可是需要密码才能打开。
零是谁?确切应该是零二世，茜和淳平似乎是见识过零，但两人矢口否认零二世与零的关系。
零的目的?茜根据西格玛的言论以及自己的见闻，知道世界上所有人类都患有“幻想症”，这种疾病会让人停止对外部刺激的反应，人类正面临一场危机。
你们的关系?茜和淳平是青梅竹马，可是两人都不太愿意谈起自己为何要加入到Dcom的实验，而卡洛斯是为了拿50万的奖金而加入的。
step3.接着在通风管道会见到狗狗加布，卡洛斯在一个卡纸上写上“C组投票给D组，D组投票给Q组，Q组投票给C组”的字样，然后放到加布的纸筒中，让加布将信息传递给Q组（管道通往Q组方向）。
可是淳平忽然提出卡洛斯之后要将票投给Q组，要么就是Q组被淘汰，要么就是卡洛斯他们被淘汰。
玩家可以选择投票给Q组或D组（其实都没所谓，之后再选择剧情片段重新选择即可，不同的选择能够开展更多的剧情分支）。
埃里克对Q的偏见很深，随后三人发现墙上有涂鸦写着“let's inhibit the virus”，随后埃里克试图拆除Q的头套，米拉却发现这个头套是需要密码才能拆除的。
而且Q与其他人不同的地方，首先他没有参加过Dcom的实验，另外他还被消除过记忆。
谁是零?米拉觉得零二世是传言所说的连环杀手，Q忽然记起了2026年的三宗命案，被害人都被开膛并且被人取走心脏，虽然Q失忆了，但他还记得这几宗案件。
我们在哪儿?首先确定是在离地面50米以下的防空洞，但具体是在防空洞的哪个位置，就不清楚了。
你们的关系?米拉与埃里克显然有暧昧之情，但是埃里克否认。
step3.随后Q他们也发现了红色的强制终止箱，而且能够轻松拿起。
接着加布从通风管道出现，Q他们看见了卡洛斯的留言，Q在纸条上留下“Q组已了解的字样”，然后将加布放入到通往D组的通风管内。
米拉并不担心D组的决定，她反而觉得这纸条是C组的圈套。
剧情：选择投票给C组，埃里克和米拉担心C组三人会死亡或者是Q组全员被处决。
但Q更愿意相信是有人想要耍他们;选择投票给D组，米拉会觉得Q此举非常有戏剧性。埃里克认为或许是C组想要D组灭亡的目的，但米拉则认为如果认为纸条是圈套，更有理由照字面意思去做，为了自卫而不那么做的说法不能成立。
派认为这是一个字谜，她曾经见识过。
而西格玛发现了强制终止箱，可是无论他怎么使劲都无法翻动它（与其他组的箱子重量不一样）。
谁是零?派与西格玛的思维和口吻的十分相似，可是他们并不了解零，但他们则认为其他人会比较清楚。而至于戴安娜加入Dcom实验，原因是她听了以前工作的护士长建议才参加的。
谁会来救援?派表示，如今他们所在的应该是火星表面，而地球如今处于太阳的另一侧，无法发送信号让人来对他们实施救援，起码要活过一天才有机会。
西格玛的说话方式?西格玛的意志原来是来自于2074年，他知道末日的情况，但并不了解2028年这个防空洞内发生的一切，所以他无法避免。
step3.接着戴安娜他们接收到从通气孔加布带来的字条，了解到其他组的意图。
派和西格玛都基本相信C组和Q组都是善意的。
剧情：选择投票给C组，派和西格玛都提出质疑，而戴安娜也不知道为什么自己要这么做;选择投票给Q组，那么派和西格玛都认为这是明智的决定。