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大战过後（想知道发生什麽事的话，大家可以玩回一代的兽乡之守护者，或者看看二代的前作剧情简介，内里亦介绍了有关上一集的片段介绍），帕迪欧和咪莉安娜来到东方，打算传授西方之神的怖教，一日在村庄遇到一名土龙族的族人，正被不知名的士兵追赶，他把手上的小孩和水晶交给你後，便会去引开追兵，但他转瞬间便被杀，而你亦被追兵发现到。 第一章：兽杀队 我方：帕迪欧，岑，琉璃
敌方：肯特，一般兵ｘ４，兽杀队士兵AＸ１，兽杀队士兵BＸ３
胜行条件：敌人彻退
重点：让玩家熟习的一关，要过版有两个方法，一是把冲过来的士兵全部收拾掉，二是冲到敌人的後方战事，他们便会知难而退。
在往札伊梅中途，在鲁巴拿遇上廉法吉尼，他的目的是为了抢夺土龙族老伯交托给你的小孩。 第二章：双境之狼
我方：帕迪欧，岑，琉璃，咪莉安娜
敌方：廉，奖人猎人Aｘ５，奖金猎人Bｘ３，奖金猎人Cｘ１
胜行条件：敌人彻退
重点：一开首先不要攻击廉，不妨先和他的首下玩玩，待每人的Level升了一定的程度後，有较大的把握，才好攻击廉。
击败廉後，受你保护的小孩突然病倒，为了冶愈小孩，众人走到附近的村落─梅特，从医生口中知道小孩的病因，但因为医生没有医冶这种病的药物，众人唯有出外找寻药草，找寻中遇上菲娜姆兵，和他们决战罢。 第三章：冶疗之国
我方：帕迪欧，岑，琉璃，咪莉安娜
敌方：水上骑兵ｘ５，一般兵ｘ７，将军ｘ３
胜行条件：敌人全部消灭
重点：先让敌人的水上骑兵接近，待解决後，慢慢以扇形的阵式逐个逐个接近对方，然後杀掉，因为站在陆地的敌人不会下水，所以只需先解决水上骑兵，便不怕有夹击的危险；走到对面的陆地後，巴特亚士将军出现，他会赶走剩下来的士兵，然後交待了一些场面话後，便会离开。
顺利把药草带回给医生，他便会医好小孩，从医生口中知道，往札伊梅的道路已经被人类封闭，众人商议後，决定改走另一条路往札伊梅，但中途遇上兽杀队第三队的队长赛克玛都那。 第四章：兽食
我方：帕迪欧，岑，琉璃，咪莉安娜，威路姆
敌方：赛克，兽杀队士兵Aｘ５，兽杀队士兵Bｘ３，水上骑兵ｘ２
胜利条件：到达指定地点
重点：以现在的实力，绝对不会是赛克的对手，所以此版一开始之时，众人快速向右边走，要留意我方的战力分怖，应该不难过关；小心不要被赛克追上哩。 正陷於绝境之际，今日子（是岑哥哥的太太）出场，以漂亮的魔法打胜赛克；之後今日子会带领大家到札伊梅的首都；为了一探威路姆的来历，众人向坤达拉进发，但中途再次被人类的军队发现。