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对于《超级机器人大战》这款游戏系列相信不必在下多加介绍，而这次NBGI《超级机器人学园》将打破传统的系列游戏类型，成为一款学园AVG冒险+ 对战的另类新作。而作为系列特色的机器人作品参战在本作自然也是少不了的，另外游戏更加入的对战系统，让玩家可以使用自己心爱的机器人与好友们一决高下。这世界在过去曾出现各种来外星以及异世界的侵略者，并从而引发数次大规模的战争，多得优秀的机器人与驾驶员们在战场上的活跃表现，才得以消除这一次又一次的威胁。为了对抗这些邪恶组织的再度出现，军队决定开展培育指挥专家计划，并开发出名为“超级机器人对战”的模拟战斗系统，把该系统设于开展课程的指挥官育成机构——超级机器人学园。
游戏的主人公，17岁的高中2 年级学生，玩家将扮演辽驾在学园中度过“超级机器人对战”的生活。
故事的女主角，住在辽驾隔壁的青梅竹马，同样是超级机器人学园的高中2 年级生，头上带着一个大大的蝴蝶结。
通过在学园内的移动场所，引发剧情，与女主人公相遇时还会出现如美少女恋爱冒险般的标志性插图剧情。顺带一提，本作的原创角色人设为日本著名的萌系美少女画师“駒都えーじ”。