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在《春风之章》中，伊贺天心已成长为著名的忍术大师，而新主角是一名活泼可爱的年轻女忍者日奈。续集的剧情更多的融入了日本战国时代的风土人情，甚至引用了诸多历史事件让角色参与其中。《春风之章》允许玩家在游戏过程中按自己的喜好去发展角色属性，同时倍受欢迎的“换装系统”也被保留了下来。《春风之章》剧情上是延承《斩断云空》的，风格上相近，比如真人语音、画风方面一点也没有变化，人物的性格也接近前作。故事发生在织田信长死后的伊贺国，丰臣秀吉借助西洋人的力量，势力正如日中天，日本国内的大名纷纷联合起来，以保全各自的家族势力。而从小就立志成为一名忍者的主人公美少女日奈，这一天终于忍不住向父母告别，来到了伊贺，拜明星人物天心小姐为师，开始了忍者的艰苦修炼……
第一章初次考验
半年后的一天，天心正传授日奈学习隐身术，突然加乃前来传信，立即到冈崎的服部半藏大人处，有新的任务指派。问过一村民后往东北方向经过大安村来到了尾张城，遇见黑市商人黑铁买到一些特殊的物品，然后继续往北到达了冈崎，刚一进村就遇见了下忍，没来得及说上几句就掉进了陷阱，看来要见到主人半藏还得接受一番考验。好在地道中并无怪物，只有一个很简单的机关，只要小心一步一步走，很容易就可以通过。见到半藏大人后，他关心的问天心一年来的生活，原来天心曾是半藏手下的忍者，一时负气出走，许久没见两人叙旧一番。之后又陆续见到替父传信的小京，同样也前来接受任务的加乃和她新收的徒弟伊夜。似乎半藏大人的任务还很有些难度，雇佣了这么多的人手，仍然不放心，还得让日奈和伊夜这两位新手参加一场测试，只有通过了才有资格做为忍者接受任务，没办法只好去此处东边凤来寺里的洞窟中取回一份卷轴。而天心和加乃两位师傅则要等她们回来再商议具体的任务。
凤来山
此时两人的等级都很低，凤来寺里面的敌人根本打不过，建议先在冈崎城外多练功升级，如果血不够了可以很方便的进城内的客栈睡一觉，除技力外，其他各项全加满，技力是每普通进攻敌人一次，就增加一些。也可到凤来寺山东边的滨名湖温泉附近练功，损血后进温泉一泡，体力、技力、术力全加满！之后，到离冈崎西边的修行山，只要多备好补血道具，把“地狱炎罗”学会更好，到游戏后期也是经常用到的技法。等级大概达到6级以上后就可以进凤来寺了，走法：进去后→拐一个ㄇ型的弯→一直走可以看见一个地藏菩萨的石像（此处存档）→先往左边拿松茸再往上走（地藏石像隔壁那条路），→进入后→直往右上的方向走→到达一个有湖水的地方→开启宝箱后得到卷轴→再与此处的BOSS妖鬼王、妖鬼后交战。
第2章正式的任务
回到半藏大人家后，终于接到了正式的任务，原来半藏的主公德川家康欲与土佐的大名，长宗日奈部接为同盟，由日奈和天心负责调查他们的真实意愿，而加乃和伊夜则去大坂监视丰臣秀吉的行动。于是大家开始各自的行动任务。出城后往西经过津港，再行至小京家，得知要到达长宗日奈部的首府冈丰必须从这里往北走→过桥后通过北边的山路→到达葛城村后继续向北→到达界港→座船前往四国的小岛村，上岸后往南→越过剑山即到。而她因为正研制出新式火枪“破头火”，即将开战而不能同行。
界港
当行至界港时，日奈解救被人当普通狸猫关在笼子里面的凌尔路义行，他会使用变身法术。在城中的最右上方又遇见了黑铁，注意及时补充高级物品，在黑铁的身旁有NPC昆塔欧雷加入，将他编入队伍可以帮助消灭敌人，而且不需要你给他加血。
物部村
经过小松岛越过剑山（选第三条岔路）后到达物部村，村的右上角又有NPC：一排地藏菩萨，与从右数第三个对话，他们就会加入到队伍了！
冈丰城
物部村西北不远就到达冈丰村，进城后天心建议大家分头行动，收集到情报后然而如果身穿忍者服或武士服，是不会得到任何情报的，要用村女装和武士服分别与全部村民对话一次，最后再回到城中最上面，过桥后和士兵对话，便可以得到消息：元亲城主现在正率军攻打被河野家抢回的汤筑城。游戏中服装的更换可按F4键，调出装备列表，其中人像右方即可看到，共有三种服装在不同的场合更换。回到会合地点，大家移至客栈详细商议。大家决定当晚就潜入元亲大人府，先看看究竟，结果偷听到两个家臣的谈话，他们议论元亲城主最近很不对劲，好象被什么东西控制住了意志似的。正在这时，大家只听得里面一阵怪叫，大喊有鬼，冲进去。
冈丰城外
出城后往西南方走，来到一处密林，门口有两个卫兵把守，硬闯进去后即可看见大片的军帐，但这里的防守十分严密，只好先退出来再做打算。经过一番调查，发现从军帐左侧向上走到最顶，然后向右是有通路的（极不容易发现）。顺路来到了军帐里面，竟然发现有个异国人正对元亲大人大施邪术，控制其意志。将打败他后，元亲大人也醒来，得知那人叫赛西欧是个传教士，而元亲大人竟还不知曾被人操纵。大家急于将这一消息告知半藏知道，幸好狸猫大哥凌尔路义行知道有一条捷径：可由此向东走有座坂山，山里有个可直通和泉一带的洞窟，通过洞窟到达对岸的淡轮村，这样就不用坐船了。
第3章回城途中
穿过山洞，看见前面有个村庄，奇怪得是许多村人全聚集在外面，走进人群一打听才知道该村南边纪之川下游的太田城里，秀吉军刚与杂贺忍者军大战一场，忍者军大败。大家一听，都非常担心小京的安危，于是一起来到太田城。
太田城
城内边地水渍一片狼籍，上二楼的最左侧的房间，见到了倒在血泊中的杂贺孙一，得知小京在楼上，上到三楼最右侧的一间房间，却只看到小京那把特制的火枪，这时走出来一个中年男子（塞西欧）说小京已被他收拾，天心拔刀冲过去却被他一掌打倒，然后又召唤出两个怪兽将众人缠住。待大家除掉怪兽后，塞西欧已经逃走。经过一番商议，大家决定还是先回冈崎。
重回冈崎
从太田城出来后，越过饭盛山，然后往右到达津港，坐船来到常滑，继续往右走到头，终于又回到了冈崎。向半藏大人报告了此次任务的调查结果，半藏不允许大家再有任何的私自行动，伙伴们只好回到了天心的家伊贺之里。回来后，天心一直都放心不下小京的安危，一天终于决定以个人的身份前往大坂，打探小京的下落，日奈甘愿被撤消忍者的称号也要加入。天心劝不过，只好答应。
第4章天心被擒由依加入
天心建议往天守阁探探，去秀吉最可能出现的地方，说不定会遇上执行另一任务的加乃她们。一行人来到丰臣秀吉的首府大坂，让狸猫大哥变成秀吉家的大臣混了进去。没料到在府内虽然遇见了加乃和伊夜，但也遇见了塞西欧、和一个武功奇高的年轻武士（四郎），尽管人数众多却不是敌手，这时四郎又使出他威力巨大的最后一击！关键时刻，天心和加乃表现出师傅的护爱之情，坚定地留下来阻挡敌人，却把日奈、伊夜、狸猫传送到淀川河畔。随后，加乃也赶到会合，告诉大家天心没有能够逃出来，但那些异国人好象会去九州，说完还交给日奈一个护身符，说是在战斗时捡到的，并让大家立即回到半藏大人处，将事情的经过原原本本的汇报，然后就离去。师傅离开后，伊夜却作主说到京都现在的异国人最多，调查要紧，日奈也很担心师傅天心的下落，于是大家决定去京都。
大坂城
从冈崎城往西到常滑→搭船到津港→往西走到纪之川→往北，过桥→继续往北走→进入三国山→往北走路经葛城村→再往西北走到一个地方有路牌→往东北走进入大坂城（若往走则进入京都）在大坂城内有一处叫姬玉殿的地方，使用在洞窟捡到的入场卷进入，可以玩民国教育、射击、拼图等几个小游戏来获得好的装备。在出来的时候，又可找到一个藏在门口一群侍女堆里面的NPC。
京都
从大坂往西北走，先过桥，看到一座城镇，就进入到京都府了。在城的左上侧河边有一NPC可加入，此处又可遇见黑铁，她会卖给你新式武器“火鸟蛋”。进城内调查得知，这附近新开了一间什么“升天圣教会”，有很多异国人来往，大家赶到城中右上方的教会所在，打听凶手塞西欧的下落，却被教士粗鲁的赶了出来。无可奈何的刚一走出门就看见一位少女昏倒在面前，原来她是饥饿过度造成的。大家将她带到河边，又给她买了许多食物，一番闲聊后得知她叫由依，正准备前往九州，由于遗失了钱财才会如此尴尬。大家也刚打听到九州一带有许多可疑的异国人在活动，见由依好象对异国人很了解的样子，就邀请她也加入到队伍中来。刚准备出城却正遇到一个少年（亚特），伊夜和他一见面就莫名其妙的一阵大吵，他立即召唤出两头怪兽，更让人疑心和塞西欧有关联。将怪兽消灭后，亚特也用隐身术逃走，大家继续前往九州。
第5章由依的身份
从京都往西走→路经猪名川村→继续往西→看到一座路牌（也可先去汤乡温泉）→走回正路继续往西→又可看见一个路牌→先往南到吉永村存档→继续往西在往下进入到关卡→战斗。
播磨
在猪名川村往西时可以看见播磨修行山和播磨村，在村的左侧可以找到NPC加入。
关卡
来到关卡的树林中时，突然遇到一个神秘黑衣人，狸猫大哥凭他的嗅觉认为是个女人，大家正在狐疑之间，那人脱掉黑外套，竟然是日奈们四处寻觅的小京。看她样子她也被洗脑了，没办法大家只好先将她制住，小京不敌，头又痛得非常难过，就这样她用隐身术走了。不过大家能够知道小京活着，心中也安慰不少，不过现在最重要的是要通过关卡，可是前面有卫兵严密防守根本过不去，只好又回到了吉永村。
吉永村
再次进入吉永村时，竟然遇到了很久没见到的伊夜的师傅加乃，她严厉的训导了日奈们一番，让日奈们赶快回到半藏大人那里，然后就急急忙忙的离开了。加乃走后，日奈和伊夜都不愿再回去，而且小京被洗脑的消息也没来得及告诉她啊，决定还是照原计划行动。在村内打探消息，终于在村内桥的另一边，从一位大婶的口中得知最近有许多异国人往妙见山跑。而在村内最右上方的房间内，穿着村女装对老爷爷说话或是穿着武士服对老奶奶说话都可以知道一条消息：妙见山内有秘道可通往高松城！于是大家来到了妙见山。
妙见山
往上直走再转弯→拿取宝箱（祭神土偶）再返回入口→从右边走→与人物对话→继续向右走→走第二条岔路向右转→往上左转直走→上楼后走第二条岔路后向右走→再向下走即到高松城府内。进入洞中即可看见庙宇的方向，对准后一直向前，即可到达，在右侧仔细寻找方发现秘道的入口。看来越靠近异国人的地方，怪物也特别多，洞中的怪物要小心应付，最好备齐补血药品。
高松城府
上楼从左边一直往下走到底→向右走到底进入楼梯→再往左直走到底向上走→走到底房前右转→往上走可拿取宝物护手甲*野火→走回原来直路再到下面那间房→拿宝箱玳瑁梳子→之后往右边的房间，直走向上→进楼梯，上楼后一直往下转弯在往上之后进入房间→再下到一个房间在房间中央右转（通过暗门），上楼梯→走到左边那个房间→由左边往上走出房间→先去拿宝箱姬玉殿招待卷→从宝箱隔壁那条路往下走转弯走到底→上楼后往左边走→与梅葳战斗。从秘道一出来就已经到了高松城的首府，大家偷听到房间内塞西欧、亚特、和他们的上级梅葳的谈话，原来这其中果然有个大阴谋，他们不仅对长宗日奈部家的元亲大人施法洗脑，而且还对其他大名也有行动。现在长宗日奈部家终于还是让他们的阴谋得逞了，已经归顺了丰臣秀吉。而异国人表面上打着帮助丰臣秀吉的旗号，暗中却意欲独自统治整个日本。就在他们准备从这里撤退的时候，大家冲了进去想要阻止他们的阴谋。却令人意外的看到梅葳和由依早就认识了，奇怪地是称呼她为“尤依莉”，并让由依随她回去，但却遭到由依坚决的拒绝。战斗终于还是开始了，梅葳显然没有想到这一群小姑娘是这么的厉害，第一回合就落败，恼羞成怒的她乘众人不备使出一招必杀技，就在这时，小京突然从出来，替大家挡住这凌厉的一击。此时四周的卫兵闻讯赶来，敌人见机逃走，如果被卫兵发现将会被当作奸细而招惹麻烦，更何况还带着受伤昏迷的小京，正在紧要关头，加乃从另一条直通到这间房的秘道出来，大家忙跟着她由此脱身。来到高松城内一间民居，大夫给小京看过伤势，幸好无甚大碍。师傅天心生死未卜，小京又昏迷不醒，尽管加乃劝大家不必自责，但日奈还是坚决的要求亲自去把师傅救回来，伊夜也吵着要一起去，加乃更不放心，幸好小京这时醒来说情，看在她的面子上，加乃才勉强答应，但嘱咐大家不要再卤莽行事了。出了门，日奈请求大家不要把异国人想统治日本这件事告诉师傅们知道。直到这时大家才知道由依真实的身份，原来她也是异国人，随异国传教士的教主奥狄姆一起来到日本，后来奥狄姆想利用她身上巫女血统的魔力，与另一个魔法极厉害的人合作就能够一瞬间掌握整个国家人民的心智，但由依却不愿意这样做，终于在另一具有正义感的异国人瑟利斯的帮助下逃了出来，后来却发现异国人仍然没有死心，继续用其他的方法仍进行着计划，现在她决心回到异国人的大本营九州，试图劝说教主奥狄姆放弃野心。伊夜对由依的身份表示怀疑，反对她再加入到队伍中来一起行动，在日奈和伙伴们的帮助下，伊夜终于退一步和由依约定以后不准私自行动的准则，由依才得以留下。准备好后，大家按原计划前往九州。
第6章渡濑静香
广岛
经过广岛时，路遇一个小姑娘求救，其实是只雌狸猫，狸猫大哥一见钟情，于是就离队帮她消灭村中的怪物去了！
木户村
往西就到达岸边的木户村，进了船夫的家，先用村女装然后用武士装与他对话，得知要替他找回漂亮假发放载大家过河，于是众人又只好先帮他找到假发。村内的假发虽多，但都不是他要的，必须先到村子最北面的一个有个路牌的后面，换上忍者装跳到河对岸，在小屋中找到假发，就会自动回到船夫处。
汤田村
坐船来到汤田村后，在靠码头的一丛树下，可找到NPC小雷神。再往西到达一个村子，刚一进去就发现村里死了很多人，而一个女子正和魔界骑士王打斗，帮助她取胜后，上前对话，得知她叫静香，正寻找两年前失散的哥哥，并拿出一个护身符，说其兄也有一个完全一样的。伊夜抢来一看，果然与加乃捡到的那个一模一样，大家告诉她主人可能已经去九州了，于是静香也加入到队伍中同行。又顺便带上村内唯一的幸存者，异国小姑娘妮妮亚，准备给她找一个地方寄养。
下关
继续往西来到下关，得知这里有座寺院，可是寺院主持一见妮妮亚是个异国的小孩，马上就将大家轰了出来，没办法看来只好带上她了。
第七章九州大陆
小仓
由下关前往小仓的船上，由依问妮妮亚是否还记得以前的事情，妮妮亚好象失去了记忆不知道她在说什么，这时日奈也上了甲板，谈话结束。坐船来到小仓后，就算踏上了九州的领土了，一下船就在码头看见了那个可怕的四郎正和一个男人谈话。静香奔上前朝四郎大喊哥哥，并劝他一起回家，可是他丝毫不为所动，正准备离开。日奈追上前质问天心的下落，却被四郎召唤出一群士兵将大家密密包围，眼看这他离去，士兵也随后自动消失。静香告诉大家，她有线索，原来她认出刚才和四郎谈话的秃顶老头，就是博多的富豪岛井宗室，只要问他就可以知道四郎的下落。向村内一个小姑娘打听到由此向西南便可以到达博多。
博多
找到岛井宗室开的店，问掌柜得知他还没有从小仓回来，大家出来后商议决定在此地等候，现在先分头打探消息，黄昏时分在客栈碰头。此处过一座桥可在右下角找到NPC一寸法师。又找一村民打听到泉巫女的事，得知此人法力高强，大家疑心她就是小泉，问一老太婆得知泉巫女现就在离此地东南方就是太宰府神社。
太宰府神社
从博多往东南方沿着黄沙地走→进入三国山→往南走到底→往右直走→看到地藏石像可存档→继续往右走直到看见路牌→往上直走→进入太宰府山道→继续往上走→到达太宰府神社。一直走进神殿里面与神官对话后，找到小泉，但小泉表示对天心的下落无法提供任何线索，但是很玄妙的告诉大家，所追踪的一行人却离她们越来越近。天色已晚，小泉留大家在此留宿一晚，恢复体力、术力后，第二天又回到博多。静香府内大家又到岛井宗室的店里去找那个秃顶老头，这次见到了他，静香说她就是四郎的妹妹，希望能帮助找到哥哥，岛井宗室却告诉静香四郎已经回家了。大家决定也赶到静香的家→府内。静香会说从这里往东，可以到达关卡。来到关卡前，静香出示通行证，过关卡，向南走就会看到一座小镇，到达府内。见到四郎后，日奈质问天心的下落，四郎却只说了句，有本事就到阿苏山的火山口，天心就在那儿，然后就离去。府内左上角会找到NPC小麒麟。
阿苏山
一出府内西南方附近就是九重山，穿过后，然后向西就可以到达阿苏山。到达山顶后，一眼就看见四郎，走上前四郎不知用什么方法一瞬间就把天心弄出来，但天心竟也被洗过脑了，四郎下令她进攻后就离去，大家只好与天心交战，天心神智不清，已不再认识任何人，落败后就使用隐身术离去。出了阿苏山顶，向西就到达隅本，又遇见手下败将亚特和塞西欧来抓由依，正当他们准备动手时，曾经帮助由依逃走的瑟利斯赶到，找借口让亚特和塞西欧离开，自己留下。他告诉由依危险还没有过去，要赶快躲起来，说完便离去。
八代港
由此向南，找到八代港，找到客栈大家住下，半夜日奈发现由依竟然不见了，急忙叫醒大家出去寻找。出村后发现由依正向一片树林走去，跟上前看见她正与瑟利斯讲话，原来瑟利斯告诉由依，好象奥狄姆也被什么力量控制了意志，才会发生了这么的变化，完全与以前的理想背道而驰……。伊夜十分生气的上前，问由依为什么违反约定私自行动，急气攻心之下感冒发作引起高烧，就病倒了。这时又路过一个人，是由依以前的老乡，将大家带到一个村庄。村长见有外人进来非常不满意，但当他看清是由依回来时，就变的非常欢喜，连忙找来助手帮伊夜把病治好。并且告诉由依，奥狄姆会到富士山建立新据点。于是大家又回到八代港，在渡口边又遇见下忍，他是来下达半藏大人的新指令，去富士山找到异国人的新据点，看看又有什么阴谋。
爱鹰山
坐船去沼津，问村民得知要去富士山必须先要到爱鹰村打听。在沼津的北边，来到爱鹰村，谁知刚一进村，村民一看到妮妮亚就全部吓的躲进屋里。在一间民房旁遇见一个神秘女子，她问大家是否需要休息，在村子西边有一间破庙可以休息。又来到爱鹰山到达爱鹰寺，大家歇下。到了半夜，却又一群村民围在寺庙外，大喊要杀掉妮妮亚，妮妮亚惊恐之下恢复了记忆，变成一个具有超能力的人，失去了理智将所有的村民杀光。大家为了阻止她的杀戮行为，只好将她抓住，带她下山到中山村，把她交给大夫治疗。大家退出房间，商议后决定立即向富士山出发。刚一出村，就在西边看到了一片颜色奇怪的森林，原来这就是通往富士山的林海迷宫。
富士山
树海迷宫：先往右走到底，然后往上，其中一处往下可得到天珠（技力的最大值在战斗时加二分之一），还可以捡到给由依使用的“最强的弓”，最后过一座桥就会遇到塞西欧和亚特。进入山洞后，往左上方一直走，就遇上了梅葳，一定要装备好防麻痹的药丸，她的法术可以让队员麻痹后无法攻击。打赢后先往右方可以捡到三个宝箱：日奈最强的武器，由依最好的防具、另一个是可以让术力全满的神之香，然后往回走，沿着岩浆往上方走，不久就可以遇到曾经帮助由依逃跑过的瑟利斯，他可以无限的帮大家补满血，还可以找他存档（这是最后一个存档的位置），从他口中得知奥狄姆已经找到了取代由依魔力的魔力石像，然后再配合富士山地下溶浆的力量就可以启动出那个可以控制全日本国的魔法。当他正要说出幕后真正的主使时，大地一阵震动，大家顾不上说许多，急忙去阻止奥狄姆。走到门口，伊夜被门上强劲的魔力震了出来，瑟利斯不惜耗费真气解开魔法结界，但无法随大家一起进入。
大结局
救到天心后，只看见奥狄姆完全失去理智，已经认不出由依，只好打败他终止他的计划。失败后的奥狄姆终于清醒，这时四郎突然出现在他的身边，一刀刺中了没有防备的奥狄姆，原来四郎也想用魔像的力量来统治日本，这样就可以保全渡濑家的势力，而他也成为整个日本的统治者。而当打败了四郎后，却没有想到莱夏又出现了，原来她才是真正的幕后主使，这一切的阴谋都是她策划的，是她用邪术控制了奥狄姆，而且大家都受骗了，终极的邪术并不是用来控制人的意志，而是将日本岛上所有的人消灭！当和莱夏战斗时是最艰苦的一战，开始她会变化成树精状的怪物，打完后才现出人形，所以不要一下子就将术力和道具用完。当莱夏被打败后，竟然还用最后的力量打向受伤在地的奥狄姆，然后纵身跳进了身后的岩浆中，以此引发终极邪术。果然地下的岩浆开始沸腾，地震开始了。由依为了拯救世界，也跳进了岩浆。日奈放声大哭，大家沉浸在悲痛中，而太阳又正升起……
游戏中的特殊地点：
六个修炼山的地点：三河地区的常滑东面、近江的界港东面、阿波的小松岛西面、播磨的猪名村西面、安芸的高松城西面、筑前的博多东面。
游戏初期如果去杂贺的鬼六之家，与他对话就会得到元气之素。天心离队后又去一次，又会得到一个卷轴。
姬玉殿里不会有什么特殊事件发生，而抽奖的特奖是“鬼刃刀”，攻击力一般，但可以吸敌人的HP。另外，建议在抽奖时先存个档，多试几次，可得到很多道具店没有的装备。
当从博多去府内的途中，过了关卡往东走有一处温泉，若穿武士服与温泉村的一个老公公对话，他会帮你占卜，并提示你说往走会有幸运的事发生，走到被一片树林挡住，再沿着河岸往上走就会发现最顶端的树其实是可以通过的，继续往右走一小段路，可以看
到上方有一个小岛，再换上忍者服装往上跳~跳~跳~就到了“开发者程序设计师之城”！
进去以后看完一些废话，其中会有两个人告诉你两条密技：
1．在换服装时，同时按住键盘的“上”“下”键就会出现日奈穿着日本女学生的隐藏水手服！可惜不能够交谈，而且也不知道有什么作用。
2．在游戏进行时按下kuukirusaikoru就可听到日奈睡觉时的音效。如果再按上一个“tab”键的话，你就会发现还有很多密技哦！
NPC的作用：找到他们后要存档就可以看见他们了，把他们加入到编队中，就可以自动攻击敌人。也可以帮助主角练功，方法是：在编队时把需要提升等级的角色单独留在战斗队伍里，其他的人全部换成NPC，这样一来一场战斗下来就会比原来多出三到四倍的经验值，如果再配上从姬玉殿玩游戏赢来的“妖鬼之角”，就更好了。虽然使攻击力减半，但可以让经验值有1。5倍！