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在《星际文明Online》中，有着很强大的舰队系统，玩家可以根据自己的战略来设计个性的战舰，并通过任命指挥官的形式来创建自己的舰队。在战舰设计的界面中，我们可以看到有不同的船体和组件选择，初始的船体模型数量较少，各方面的性能也较为一般，随着个人技能的不断提升将会激活更多的船体样式，高级船体相对的性能上就会优越很多。在选择完船体后就是决定要在船上安装哪些组件，组件包括有发射器、储存仓、殖民仓等。你可以随心所欲的设计自己的战舰，充满攻击性武器的侵略型舰队，甚至是仅仅能到达其他星系的观光舰队，又有什么不可以？没有定律，个性才是王道！
俗话说，一个好的团队离不开一个优秀的领导者…所以呢，《星际文明Online》为玩家准备了相当富有挑战性的指挥官系统，玩家本身就是指挥官，除此之外，玩家还能通过招募指挥官系统来随机抽取更多的指挥官，指挥官有分为一般指挥官，特殊指挥官等不同级别，而会抽取到哪一等级的完全就是看人品啦，完全随机性的设计增加了游戏的趣味性，而且属性比较高的指挥官往往能在败局中起到扭转乾坤的作用哦！另外，玩家还能为自己的指挥官们命名，要走的就是最个性的路线！
在拥有了强大的战舰和优秀的指挥官后，玩家就可以创建自己的超级舰队啦。在创建舰队界面，玩家还能够对舰队的阵型以及所处的位置进行编排，不要小看这个阵型哦，它可是对队伍战斗力有着不小的影响力呢。同样的战舰编排不同的阵型会产生不同的战斗效果，大家可以更多的进行尝试，以自己认为最强大的方式来组织自己的舰队，展现你最个性的一面！
通过以上三步，你就拥有了属于自己的超级舰队，可以开始你的星际征战之旅啦，出发吧，为了荣誉而战！