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既然坏蛋把犯罪网络定义在地铁肯定和地下的某些设施有联系，先揍几个混混问问究竟，对方也不知道姑且先放过吧。镜头转到史莱德这边，他正和巴克斯特商量怎么除掉忍者神龟们。
史莱德：“巴克斯特，老子给你这么多好处，你丫出点力吧”
巴克斯特：“安心吧，我会干掉乌龟们，我有我的秘密武器”经典的反派对话，这种结果往往是被干掉。
继续前进会有红色耗子，这玩意会自爆的小心点，被炸到菊花一定爽。随后一行人沿着下水道来到耗子的运输流水线。看来要先破坏掉输送装置了。
来到控制室，这里增加的白色忍者会扔手雷还有新型的老鼠头机器人，硬入狗，用雷电手里剑能很好牵制在干掉。