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玩家将在《伊克西翁IXION》中带领居民寻找新的居住地，游戏的经营元素与剧情相融合，故事具有深刻的内涵。想要了解游戏内容的玩家，可以查看以下由“小水B”提供的《伊克西翁IXION》剧情详细解读。游戏名称ixion源自希腊神话，伊克西翁是一个国王，因为爱上了一位外国公主，便将国库中所有的财宝许诺给了公主的父亲（即另一位国王），并迎娶了公主。然而，他又反悔了，不愿将财宝交给公主的父亲，于是谋杀了他。后来，他逃到宙斯那里，宙斯原谅并收留了他。但伊克西翁对宙斯的妻子赫拉产生了爱慕之心，最终被宙斯绑在一个不停旋转的火轮上，身受严重的惩罚。ixion在游戏中明示或暗示指的是太坤空间站及其人员。然而，最后通关动画揭示了dolos一直在试图拯救人类，而代表地球的联合国才是真正的伊克西翁。在序章炸月球的情节中，很多人都会有疑惑，为什么要在空间站航行到月球轨道后才启动V引擎导致月球爆炸，而不是找一个没有星球或距离较远的星球。
需要考虑到通关动画中的一段台词，dolos说：“当他意识到月球必将毁灭时”，值得注意的是，这段通关动画是在太坤空间站首航之前，也就是序章启动V什么玩意引擎之前就已经制作完成。因此，无论太坤空间站是否存在，月球都注定会在那个时刻爆炸，也就是说，月球的爆炸与太坤空间站没有任何关系，只是碰巧与V引擎的启动时间重合了。
当你游玩太坤空间站时，埃登，它的私人助手会告诉你，太坤号没有生成跃迁终点坐标的计算机。因此，在游戏的每个章节中，你需要在各个星系内寻找跃迁坐标。太坤号无法确定要前往哪个星系，只能前往一系列已设定好的目的地。
在序章中，dolos告诉你，太坤号需要前往半人马比邻星进行测试，然后返回。但实际上，启动引擎跃迁后，太坤号仍停留在原地，只是经过了许多年的时间（以地球时间计算）。结合前文所述，以及外部希望号和ixion引擎事件的发生，dolos从一开始就计划将太坤号作为方舟发送到未来的某个时间。
提及那个超光速粒子，游戏中许多事件都和它息息相关。下面几个事件值得一提：首先有位船员称他透过超光速粒子看到了地球的毁灭；其次是有第二个奇怪的球体（第一个是在双尾彗星中），如果进行深入探查则会失去一艘科研船和五个船员，但在探查最后一个星系中的球体时，这些船员和船会回来。而他们说明他们被困在了超光速粒子里面；第三则与不同颜色防护服的船员有关；第四是关于太坤号残骸和明明没有死却找到尸体的船员等。这些神秘的事件似乎无一不与超光速粒子有关。太坤号的引擎也是以此粒子为基础制造，这表明这种粒子拥有某种特性，可以与时间和空间相互作用。由此推测，dolos极有可能是通过这种粒子发掘出人类即将毁灭的事实，进而得以开发太坤号。
说到炸月球这一事件，从游戏流程来看，使用带有超光速粒子引擎是相对安全的，只有可能对船体造成损伤，而不会引起星球爆炸。再加上后续可以看到，海盗船皮拉内西号可以跟随太坤号的超空间航迹进入了第五章的星系。因此，在月球爆炸的位置，肯定有一些船在某个时间点进入或退出了自相似空间。既然使用超光速粒子引擎是相对安全的，那么造成这种损害的就应该是一艘未使用超光速粒子引擎的飞船。仔细想想，剧情中只有联合国飞船使用了这种引擎，而幸存者表示他们的飞船并没有使用超光速粒子引擎。
因为联合国飞船没有在进入自相似空间时使用超光速粒子，所以月球所在的常规时空位置被撕裂了一个口子，这导致太坤号能够通过这个被称为“唯一的发射窗口（dolos说的）”的开口航行到了很多年以后（地球时间）。这种航行方式造成了月球被V什么引擎撕裂的假象。
此外，关于序章的彩蛋，如果选择给资源，通讯中的最后一句话非常有趣：“相信基因倾向力，自相似空间会给出范例”。这句话似乎是公司的宣传口号，但是和外星人所说的话结合起来就更有意思了，他说：“我们遵循自相似模式，遵循基因倾向力”。
这两句话毫不相关吗？外星人说，我们视dolos为我们的最亲密盟友，他是实践尼奥孔德*巴哈维尔教义的人。从这句话来看，很明显dolos非常熟悉这些外星人。外星人也提到，dolos对他们提供了帮助。但问题是，dolos帮助他们做了什么呢？外星人创建了一个与地球人不同的环境友好社会，而在dolos的演讲中，他把地球的毁灭归咎于无限制的资源采集。外星人说，他们只想追求尼奥孔德教义中的基因倾向力。因此，有可能是dolos通过超光速粒子向外星人传授了基因技术，并帮助他们逃脱了灭亡，现在外星人则帮助人类逃离相似的命运。
在寻找宜居星球的过程中，我们都知道这是一项艰巨的任务。即使在同一星系中找到两颗宜居星球也很不容易。因此，当你选择摧毁太坤号的AI私人助手埃登，以便开发“不存在的星球”时，跳出的事件“最后的遗言”中，埃登提到了dolos曾说过这个星球不宜居。很有可能埃登并没有说谎，因为dolos所说的是真实的。实际上，这个星球不适合居住。此外，当太坤号飞行到外星人的星球和不存在的星球时，都会出现动画。仔细观察，你会发现外星人星球有蓝色的海洋和茂密的植被，看起来是一个很好的地方。而“不存在的星球”看起来黄白斑驳、很平淡无奇，因此dolos的确想拯救人类。