眼看：水晶玉在形成过程中，往往受环境影响总含有一些杂质，对着太阳观察时，可以看到淡淡的均匀细小的横纹或柳絮状物质，而水晶石多采用残次的水晶渣、玻璃渣熔炼，经过磨光加工、着色仿造而成，没有均匀的条纹、柳絮状物质；
舌舔：即使在炎热夏季的三伏天，用*天然水晶表面，也有冷而凉爽的感觉，水晶石，则无凉爽的感觉；
光照：水晶玉竖放在太阳光下，无论从哪个角度看它，都能放出美丽的光彩，水晶石则不能；
硬度：水晶玉硬度大，用碎石在饰品上轻轻划一下，不会留痕迹；若留有条痕，则是水晶石；
用偏光镜*：在偏光镜下转动有四明四暗变化的是天然水晶，没有变化的是水晶石；
用二色*：紫水晶玉有二色性，水晶石没有二色性；
用放大镜*：用十倍放大镜在透射光下*，能找到气泡的基本上可以定为水晶石；
用头发丝*：将水晶放在一根头发丝上，人眼透过水晶能看到头发丝双影的，则为水晶玉，主要是因为水晶具有双折射；
用热导仪检测：将热导仪调节到绿色测试宝石，水晶玉能上升至*，而水晶石不上升，当面积大时上升至*一格。